En cuanto a si congelarse se puede usar solo.

En el ejemplo, congelar no tiene nada que ver con congelar, pero es una preposición independiente, por lo que solo puedes buscar congelar y congelar en el diccionario. El uso en oraciones sólo enfatiza el significado de "en/en...". Este es el uso especial de in en los verbos compuestos. El Diccionario bilingüe inglés-chino avanzado de Oxford tiene varios ejemplos para ayudarle a comprender este uso.

Quedamos atrapados

Ella abrió la puerta y entró

Los niños estaban jugando junto al río y uno de ellos cayó al río

Por el contrario, el primer ejemplo es más similar a la oración que usted dio. En cuanto a la entrada en el puerto que mencionaste antes, es una frase preposicional que se usa para describir un barco y no entra en conflicto con la segunda entrada.

Además, hay varios ejemplos después del sustantivo.

Llamé pero ¿no había nadie?

No me gusta el café con leche