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Hace muchos años, un joven llamado Giovanni Guasconti dejó su casa en Nápoles para estudiar en el norte de Italia. Alquiló una habitación en una casa antigua junto a un espléndido jardín lleno de extrañas flores y otras plantas.
El jardín pertenece al médico Giacomo Rappaccini. En la pequeña casa marrón del jardín vivía con su hija Beatrice. Desde una ventana de su habitación, Giovanni había visto a la hija de Rappaccini, que era muy hermosa. Pero todos en Padua le tenían miedo a su padre.
Pietro Baglioni, profesor de la universidad, advierte a Giovanni sobre el misterioso doctor Rappaccini. "Es un gran científico", le dijo el profesor Baglioni al joven. "Pero también era peligroso. A Rappaccini le importaba más la ciencia que las personas. Había producido muchos venenos terribles a partir de las plantas de su jardín".
Un día, Giovanni descubrió la puerta de entrada a El secreto de Rappaccini. entrada al jardín. Él entra. Todas las plantas parecían salvajes y antinaturales. Giovanni comprendió que Rappaccini debía haber producido estas extrañas y horribles flores a través de sus experimentos.