Clasificación de los Cóndores Andinos
El cóndor andino fue descrito por Carl Linneo en 1758, y su nombre científico original todavía se utiliza en la actualidad. El nombre de su género proviene directamente del latín "buitre". El apodo de la especie proviene del griego antiguo "γρυπ", que significa "nariz ganchuda".
Aún se desconoce la clasificación precisa del cóndor andino y otras seis especies de buitre del Nuevo Mundo. Aunque los buitres del Nuevo Mundo y los buitres del Viejo Mundo tienen apariencias similares y nichos ecológicos cercanos, se originaron en lugares diferentes y ancestros no relacionados. La distinción entre los dos todavía se debate, con las primeras afirmaciones de que los buitres del Nuevo Mundo están más cerca de las cigüeñas, y afirmaciones más recientes de que deberían clasificarse junto con los buitres del Viejo Mundo en el orden Falconiformes o en un orden separado de buitres americanos. La Unión Estadounidense de Ornitólogos cambió el estado de los buitres del Nuevo Mundo del orden Storkidae a indeterminado y señaló la posibilidad de clasificarlos en el orden Falconiformes o Buitres.
No cuentan con una gran cantidad de fósiles como el cóndor de California, y sólo cuentan con un registro fósil insuficiente. Algunas especies sudamericanas del Plioceno o Pleistoceno son indistinguibles del cóndor andino, y los pequeños huesos encontrados en Tarija, Bolivia, pertenecen a la antigua subespecie V. g. patruus del cóndor andino.