Cómo configurar el paso de tiempo y el número de pasos para la simulación de dinámica molecular
He estado expuesto a la dinámica molecular por un corto tiempo y ahora uso software de MS. Permítanme compartir mis conocimientos. Agradezco críticas y correcciones.
El paso de tiempo predeterminado es 1fs, que puede entenderse como el tiempo que lleva dar un paso. Cuanto menor sea el valor, más preciso puede ser. Generalmente, no es necesario ajustarlo. a menos que el sistema sea muy grande y no requiera pasos tan pequeños y precisos.
Número de pasos: Cuanto mayor es el número de pasos de simulación, más cerca está el sistema del estado de equilibrio, pero el tiempo también es mayor, por lo que es necesario encontrar un equilibrio entre precisión y tiempo. No es mejor. Considere esto.
Los dos valores anteriores deben probarse usted mismo basándose en problemas de cálculo reales. También puede consultar literatura de cálculo similar. Esta es la forma más rápida.