¿Hay algún impacto si la firma de apktool no obtiene el número de versión actualizado?

Sí. Cuando se utiliza una herramienta de firma para firmar un software, debido a que el número de versión es limitado, provocará la pérdida de datos, por lo que tiene un impacto. La firma sirve para marcar el archivo apk que se publicará para garantizar que su archivo apk tenga una certificación de identidad única. Solo se pueden sobrescribir e instalar archivos con la misma firma y el mismo nombre de paquete y conservar la información del usuario.