Introducción al software DP-GEN

1. Introducción al Plan de Desarrollo para la Igualdad de Género

DP-GEN (Deep Generator) es un software escrito en Python que puede generar modelos de energía potencial interatómica y campos de fuerza basados ​​en el aprendizaje profundo. DP-GEN depende del kit DeepMD. A través de interfaces altamente escalables con software de simulación molecular como VASP y CP2K, DP-GEN puede generar scripts automáticamente y mantener colas de trabajos y resultados de análisis en clústeres de alto rendimiento.

Actualmente, DP-GEN admite sistemas HPC (Slurm, PBS, LSF y máquinas en la nube), la interfaz de potencial profundo del kit DeePMD, la interfaz MD de LAMMPS, las interfaces de cálculo ab initio de Gromacs y VASP, PWSCF, CP2K, SIESTA y Gaussiano et al.

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Los usuarios que utilizan este software deben cita Referencias a:

Haiti Wang, Jinzhe Zeng, Zhang y Nane Wei, DP-GEN: Una plataforma de aprendizaje paralelo para generar modelos de energía potencial confiables basados ​​en el aprendizaje profundo, Computer Physics Communications, 2020,107206.

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2.

En tercer lugar, arquitectura del software DP-GEN

Cuatro comandos y formatos

TASK es una palabra clave, PARAM y MACHINE son archivos en formato JSON.

Puedes comprobar la racionalidad de json a través del siguiente script.

Cuatro.

Descarga e instala

Luego sigue estos pasos: